KÖLN / LONDON (IT BOLTWISE) – Phagestack, ein Startup aus Pulheim, hat im BioCampus Cologne ein eigenes Labor eröffnet. Das Unternehmen entwickelt eine datenbasierte Plattform, mit der antimikrobielle Wirkstoffe gezielt gegen bestimmte schädliche Bakterien entwickelt werden sollen. Die Finanzierung kommt über NRW.SeedCon, flankiert durch weiteres Startup-Ökosystem-Supporting. Im Fokus stehen dabei insbesondere Bakteriophagen, die als Präzisionswerkzeuge im Kampf gegen Antibiotikaresistenzen eingesetzt werden sollen.
Phagestack bringt damit eine Idee deutlich näher an die Anwendung: Aus einer datenbasierten Entwicklungslogik wird nun auch ein eigener „Nasslabor“-Pfad. Das Startup aus Pulheim eröffnet sein Labor im BioCampus Cologne und will so seine Machine-Learning-Verfahren und die dahinterliegenden Datenressourcen enger mit praktischer Validierung verzahnen. Während frühe Entwicklungszyklen häufig bei in silico-Analysen enden, soll der Schritt ins Labor die Brücke zwischen Modellvorhersagen und belastbaren Kandidaten schlagen.
Technisch beschreibt Phagestack den Kernansatz als Kombination aus Machine-Learning-basierten Verfahren und Datenbanken mit biologischen Wirkstoffen sowie Labordienstleistungen. Das Ziel ist nicht, möglichst „breit“ gegen viele Erreger vorzugehen, sondern Präzisionslösungen gegen ausgewählte schädliche Bakterien zu entwickeln. Diese Unterscheidung ist entscheidend, weil Breitbandantibiotika zwar effektiv sein können, aber auch nützliche Bakterien und mikrobielle Ökosysteme mit in Mitleidenschaft ziehen. Mit gezielteren Eingriffen will das Unternehmen das Risiko weiterer Resistenzen verringern und gleichzeitig die Wirkung dort erhöhen, wo sie gebraucht wird.
Im Mittelpunkt stehen Bakteriophagen: Viren, die bestimmte Bakterien befallen und daher als selektive biologische Agenzien eingesetzt werden können. Phagestack setzt dabei auf einen Prozess, der von der anfänglichen Identifizierung relevanter Zielstrukturen bis zur experimentellen Validierung reicht. Laut Unternehmensbeschreibung sollen Wirt-Erreger-Zielstrukturen nicht nur datengetrieben identifiziert, sondern anschließend im Nasslabor „praxisnah“ untermauert werden. Dabei geht es auch um die Bereitstellung standardisierter, hochwirksamer Phagenpräparate, damit Partner die Ergebnisse reproduzierbar in eigenen Workflows weiterverwenden können.
Der neue Laborausbau erweitert aber nicht nur die Ergebnisqualität, sondern auch das Spektrum der Services. Phagestack koppelt die digitalen Datenressourcen künftig mit eigenen Laborkapazitäten, um Wirkstoffkandidaten nicht nur algorithmisch zu identifizieren, sondern sie auch direkt im Labor zu untersuchen und zu validieren. Zusätzlich soll das Angebot um maßgeschneiderte Isolierung und Charakterisierung von Phagen wachsen, ergänzt durch In-vitro-Screenings und genomische Verifizierungen. Je früher diese Schleife „Modell → Experiment → Verifikation“ greift, desto schneller können Entwicklungsteams Fehlannahmen aus dem Trainings- oder Datenraum erkennen, bevor sie in die nächsten Iterationen teuer werden.
Finanziert wird der Aufbau der Laborkapazitäten über NRW.SeedCon, einem Programm der NRW.BANK, das Phagestack dabei unterstützen soll, modernste Technologien aus dem Labor in die Praxis zu bringen. Die Beteiligung zielt dabei nicht nur auf die Anschaffung von Hardware, sondern auch auf die Fähigkeit, den Entwicklungsansatz kontinuierlich weiterzuentwickeln und neue Lösungen gegen Antibiotikaresistenzen vorzubereiten. Aus der Perspektive von Biotech-Startups ist genau diese „Operationalisierung“ häufig der Engpass: Software und Daten reichen nicht, wenn am Ende robuste Testreihen, standardisierte Präparate und nachvollziehbare Validierungsschritte benötigt werden.
Für den Markt bedeutet das vor allem, dass Präzisionsbiologie näher an einen wiederholbaren Engineering-Ansatz rückt. Das Unternehmen nennt neben dem Gesundheitsbereich auch Einsatzfelder in Aquakultur, Landwirtschaft und Lebensmittelproduktion. Gerade dort sind Wechselwirkungen mit Mikrobenpopulationen ein wiederkehrendes Thema, und präzise Interventionen können wirtschaftlich und ökologisch relevanter werden als pauschale Behandlungen. Gleichzeitig steigt der Entwicklungsdruck: Wer in diesem Bereich nur „einmalig“ liefert, hat es schwer, langfristige Partnerschaften aufzubauen; wer hingegen validierte Kandidaten und standardisierte Präparate bereitstellt, kann leichter in Piloten, Kooperationen und späteren Skalierungsschritten überzeugen.
Insgesamt zeigt die Laboreröffnung, wie sich KI-Entwicklung in der Biologie zunehmend verändert: KI liefert nicht mehr nur Vorschläge, sondern wird Teil einer durchgängigen Pipeline, die auch die experimentelle Gegenprüfung organisiert. Für Phagestack heißt das konkret, dass Algorithmen und Datenbanken durch Labortests praxisnah „eingehängt“ werden und die Zusammenarbeit mit Partnern von der frühen Zielstruktur bis zur Bereitstellung biologischer Wirkstoffe reicht. Damit verschiebt sich der Wettbewerbsvorteil von reiner Modellgüte hin zur Fähigkeit, Datenaufbereitung, Modelliteration und experimentelle Validierung als ein gemeinsames System zu betreiben. Genau an diesem Punkt entscheiden sich oft die nächsten Schritte vom Forschungsprojekt hin zu einer wiederholbaren Produktentwicklung.
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