Einfluss von Darmbakterien auf die Gehirnproteine

MÜNCHEN (IT BOLTWISE) – Neue wissenschaftliche Erkenntnisse zeigen, dass Darmbakterien die chemische Modifikation von Gehirnproteinen durch Zucker beeinflussen können. Diese Entdeckung könnte weitreichende Auswirkungen auf das Verständnis der Gehirnfunktion und möglicher neurologischer Erkrankungen haben.

Die jüngste Studie, veröffentlicht in Nature Structural and Molecular Biology, liefert bahnbrechende Beweise dafür, dass Darmbakterien die Art und Weise beeinflussen können, wie Proteine im Gehirn durch Zucker chemisch modifiziert werden, ein Prozess, der als Glykosylierung bekannt ist. Mithilfe einer neuen Methode namens DQGlyco konnten Forscher die Glykosylierung im Gehirn mit bisher unerreichter Auflösung analysieren und zeigen, dass unterschiedliche mikrobielle Populationen im Darm diese Muster verändern können, was möglicherweise die Gehirnfunktion beeinflusst.

Die Glykosylierung von Proteinen ist ein biologischer Prozess, bei dem Zuckermoleküle an Proteine gebunden werden, um deren Funktion, Interaktion und Kommunikation innerhalb und zwischen Zellen zu regulieren. Während dieser Prozess in vielen Körpersystemen eine wichtige Rolle spielt, war seine Beteiligung im Gehirn aufgrund der Komplexität und Vielfalt der Zuckermodifikationen schwer zu untersuchen. Frühere Studien waren auch durch technische Einschränkungen bei der Identifizierung und Quantifizierung der vielen Formen der Glykosylierung, die an einem einzelnen Protein auftreten können, begrenzt.

Um diese Herausforderungen zu überwinden, entwickelten Forscher eine Methode namens Deep Quantitative Glycoprofiling, oder DQGlyco. Diese neue Technik ermöglicht es Wissenschaftlern, die Glykosylierung von Proteinen in einem bisher nicht möglichen Maßstab und mit einer bisher nicht erreichten Auflösung zu messen. Das Team nutzte DQGlyco, um zu untersuchen, wie Glykosylierungsmuster im Mausgehirn durch verschiedene Darmmikrobiome beeinflusst werden.

Die Studie begann mit der Validierung der DQGlyco-Methode sowohl in menschlichen Zellen als auch in Mausgehirngewebe. Diese Methode kombiniert verbesserte Probenvorbereitung, hochsensible Detektion und präzise Markierungstechniken, um Glykopeptide zu isolieren und zu analysieren – Proteinfragmente mit angehängten Zuckerketten. Die Forscher wendeten ihre Methode auf Gehirngewebe von Mäusen an und identifizierten über 177.000 einzigartige Glykopeptide. Dies ist mehr als 25-mal so viele wie in früheren Studien identifiziert wurden und bietet einen beispiellosen Einblick in das Gehirn-Glykoproteom.

Mit diesem erweiterten Datensatz entdeckten die Forscher weit verbreitete „Mikroheterogenität“ – das bedeutet, dass einzelne Stellen auf einem Protein oft viele verschiedene Zuckerformen, sogenannte Glykoformen, trugen. Im Durchschnitt fanden sie etwa 17 Glykoformen pro Stelle, und in einigen Fällen mehr als 600 verschiedene Glykoformen an einem einzigen Ort. Diese Variation war nicht zufällig. Stellen mit größerer Mikroheterogenität befanden sich häufiger in strukturierten und zugänglichen Teilen des Proteins, was darauf hindeutet, dass strukturelle Merkmale bestimmen, wie extensiv Proteine glykosyliert werden.

Die Studie zeigte auch, dass bestimmte Arten der Glykosylierung – wie solche, die spezifische Zuckertypen wie Fucose oder Sialinsäure beinhalten – häufiger auf bestimmten Proteindomänen vorkamen, wie solchen, die an der Immunantwort oder Zelladhäsion beteiligt sind. Diese Erkenntnisse legen nahe, dass die chemische Vielfalt der Zuckermodifikationen funktional relevant sein könnte und beeinflusst, wie Proteine interagieren und ihre Rollen erfüllen.

Um den Einfluss des Darmmikrobioms auf die Gehirnglykosylierung zu untersuchen, führten die Forscher Experimente mit keimfreien Mäusen durch. Diese Mäuse wurden entweder steril gehalten oder mit verschiedenen Bakterienpopulationen kolonisiert, darunter eine einzelne häufige Darmart oder eine definierte Gemeinschaft von acht Bakterien. Zwei Wochen später analysierten die Forscher das Gehirngewebe der Mäuse.

Die Ergebnisse zeigten erhebliche Unterschiede in den Glykosylierungsmustern zwischen den Gruppen. Über 2.500 Glykopeptide im Gehirn wurden durch das Vorhandensein oder Fehlen von Darmmikroben beeinflusst. Diese Veränderungen waren besonders ausgeprägt bei Proteinen, die an der Neurotransmission beteiligt sind, wie Glutamatrezeptoren und Ionenkanäle. Viele der veränderten Glykoformen befanden sich an Stellen mit hoher Mikroheterogenität, was darauf hindeutet, dass mikrobielle Signale die dynamischsten glykosylierten Regionen von Gehirnproteinen beeinflussen könnten.

Interessanterweise wurden nur wenige Änderungen in der Proteinmenge beobachtet, was darauf hindeutet, dass die Unterschiede nicht auf Änderungen in der Proteinproduktion zurückzuführen waren, sondern darauf, wie diese Proteine nach ihrer Herstellung modifiziert wurden. Zusätzliche Experimente zeigten, dass Glykosylierungsänderungen auch mit Unterschieden in der Proteinlöslichkeit und thermischen Stabilität verbunden waren, zwei Indikatoren für Änderungen in der Proteinfunktion oder -lokalisierung.

Die Studie fand auch heraus, dass bestimmte Glykoformen eher an der Zelloberfläche exponiert waren, indem Enzyme verwendet wurden, um Zucker oder Proteine von intakten Zellen selektiv abzutrennen. Oberflächenexponierte Glykoformen neigten dazu, komplexer und weiterverarbeitet zu sein, während hochmannose Formen – oft als unreif angesehen – weniger zugänglich waren. Dies half, zwischen Proteinen zu unterscheiden, die noch innerhalb von Zellen verarbeitet wurden, und solchen, die an der Zelloberfläche funktionierten.

Durch die Kombination von tiefem Profiling mit strukturellen Vorhersagen von AlphaFold erstellten die Forscher ein Modell, das vorhersagen konnte, ob eine bestimmte Glykosylierungsstelle wahrscheinlich hochvariabel war oder nicht. Dieses Modell, basierend auf struktureller Exposition und Faltung, unterschied erfolgreich zwischen Stellen mit hoher und niedriger Mikroheterogenität und deutete darauf hin, dass Glykosylierungsmuster durch die 3D-Struktur von Proteinen beeinflusst werden.

Während die Ergebnisse neue Richtungen für das Verständnis der Darm-Hirn-Achse eröffnen, hat die Studie mehrere Einschränkungen. Die Experimente wurden an Mäusen durchgeführt, sodass noch unklar ist, wie direkt die Ergebnisse auf Menschen anwendbar sind. Die Studie maß auch Glykosylierungsmuster zu einem bestimmten Zeitpunkt, was bedeutet, dass die dynamische Natur dieser Veränderungen über längere Zeiträume unbekannt bleibt. Darüber hinaus wurden, obwohl Änderungen in der Glykosylierung mit strukturellen und biophysikalischen Änderungen in Proteinen verbunden waren, die funktionalen Konsequenzen für Verhalten oder Gehirnaktivität nicht direkt getestet.

Zukünftige Forschungen könnten untersuchen, wie diese Glykosylierungsänderungen die neuronale Entwicklung, Kognition oder das Krankheitsrisiko beeinflussen. Die Autoren schlagen auch vor, dass ihre DQGlyco-Methode auf menschliches Gewebe oder Krankheitsmodelle angewendet werden könnte, um Glykosylierungssignaturen zu identifizieren, die mit neurologischen oder psychiatrischen Störungen verbunden sind.

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