SAN DIEGO / LONDON (IT BOLTWISE) – Forscher der Universität von Kalifornien in San Diego haben eine bahnbrechende Technologie entwickelt, die das gesamte Netzwerk von RNA-Protein-Interaktionen in menschlichen Zellen aufdeckt. Diese Entdeckung könnte neue Wege zur Behandlung von Krankheiten wie Krebs und Alzheimer eröffnen.
Wissenschaftler der Universität von Kalifornien in San Diego haben eine innovative Technologie entwickelt, die das gesamte Netzwerk von RNA-Protein-Interaktionen in menschlichen Zellen sichtbar macht. Diese Entwicklung könnte neue Einblicke in die Entstehung von Krankheiten wie Krebs und Alzheimer bieten. Die Methode friert RNAs und Proteine ein und markiert sie, während sie sich berühren, und verwandelt sie in einzigartige DNA-Barcodes, die mit Sequenzierung entschlüsselt werden können.
In Tests hat das System mehr als 350.000 Interaktionen aufgedeckt, darunter unerwartete Verbindungen zu Alzheimer- und krebsbezogenen Signalwegen. Indem diese verborgenen zellulären Gespräche aufgedeckt werden, könnte die Entdeckung die nächste Generation von Behandlungen leiten, die auf die molekularen Treiber von Krankheiten abzielen. Diese Technologie bietet nicht nur Einblicke in die Interaktionen, sondern zeigt auch, welche Region des Proteins beteiligt ist und welche RNA-Sequenzen von einem bestimmten Protein bevorzugt werden.
Die neue Technologie funktioniert, indem sie den Moment einfriert, in dem RNAs und Proteine physisch in Zellen in Kontakt stehen. Jedes Protein wird markiert und chemisch mit der RNA verbunden, an die es bindet. Diese RNA-Protein-Paare werden dann in einzigartige DNA-Barcodes umgewandelt, die mit Standard-Sequenzierungsmaschinen gelesen werden können. Das Ergebnis ist ein umfassender Katalog von RNA-Protein-Interaktionen, der in einem einzigen Experiment produziert wird.
Ein bemerkenswertes Beispiel ist das Enzym Phosphoglycerat-Dehydrogenase (PHGDH), das als kausales Gen für Alzheimer identifiziert wurde. In dieser Studie wurde festgestellt, dass PHGDH an Boten-RNAs bindet, die mit Zellüberleben und Nervenwachstum verbunden sind. Diese Entdeckung könnte neue Wege aufzeigen, wie PHGDH die Gesundheit des Gehirns beeinflusst. Die Fähigkeit, solche verborgenen Interaktionen zu sehen, könnte neue Medikamentenziele und Behandlungsansätze aufdecken.
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